A principios de la década de 1930, en Chicago, el tren transcontinental Flying Pussyfoot emprende su legendario viaje que dejará un reguero de sangre por todo el país. Al mismo tiempo, en Nueva York, el ambicioso científico Szilard y su reticente ayudante Ennis buscan las botellas perdidas del elixir de la inmortalidad. Además, la guerra entre grupos mafiosos se agrava. A bordo del Advena Avis, en 1711, los alquimistas están a punto de descubrir el precio de la inmortalidad.

Basada en las galardonadas novelas ligeras del mismo nombre, Baccano! sigue varios eventos que inicialmente parecen inconexos, tanto en tiempo como en espacio, pero que forman parte de una historia mucho más grande: una de alquimia, supervivencia e inmortalidad. Estos eventos se fusionan con los bondadosos aspirantes a ladrones, Isaac y Miria, conectando a varias personas, cada una con sus propias ambiciones y agendas ocultas, y creando vínculos que durarán toda la vida y tendrán consecuencias para todos los involucrados.